V večini biokemijskih učbenikov je pri encimatiki najti le Michaelis-Mentenovo enačbo, ker je slednjo lahko preoblikovati v linearno obliko, grafično prikazati in podatkovno analizirati podatke encimsko kataliziranih reakcij. A večina encimov ne sledi Michaeli-Mentenovi kinetiki in pogostokrat kažejo ali substratno aktivacijo ali inhibicijo kot v primeru holinesteraz, ki jih je mogoče opisati z Webbovo hitrostno enačbo. Uporaba slednje pa je omejena na analizo podatkov hitrost proti koncentraciji substrata. Razumevanje in študij encimske kinetike pa je lahko nepopolno, če ni na voljo analitične rešitve hitrostne enačbe, ki bi praktično opisala neposredno časovno odvisnost koncentracije reaktantov. V prispevku je podana analitična aproksimacija enačbe, ki omogoča neposredno modeliranjeWebbove kinetike s standardnimi računalniškimi programi. Eksplicitna narava opisanih aproksimacij omogoča raziskovalcem in študentom preprosto in neposreden izračun kinetičnih parametrov iz surovih eksperimentalnih podatkov brez klasičnih transformacij. Posledično bi opisana vsebina lahko postala tudi pomembna sestavina učnega načrta moderne encimologije 21. stoletja.
F.23 Razvoj novih sistemskih, normativnih, programskih in metodoloških rešitev
COBISS.SI-ID: 30847449Paraoksonaza-1 (PON1) se zadnjih deset let veliko študira kot potencialni biomarker pri srčno-žilnih in neurodegenerativnih boleznih. Zaenkrat sta edini metodi za določanje vsebnosti PON1 merjenje fenilacetatne in paraoksonazne aktivnosti ter relativno določanje koncentracije z ELISA testom. Razvoj drugih diagnostičnih metod zahteva poznavanje mehanizma delovanja od kalcija odvisnega encima PON1 in vezavo/inhibicijo ligandov (npr. analogov prehodnega stanja) v aktivni center. To je dobro izhodišče za razvoj metode, ki bi bazirala na zamenjavi 'aktivnega' kalcija z lantanidnimi ioni. Slednji lahko ob hkratni vezavi ustreznega liganda/antene v aktivni center encima luminiscirajo kar omogoča določanje vsebnosti encima v vzorcih. Omenjena študija predstavlja izhodišče za nadaljni razvoj novih diagnostičnih postopkov.
F.21 Razvoj novih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov
COBISS.SI-ID: 31520729Objavili smo genomska zaporedja štirih varietet črne kvasovke Aureobasidium pullulans s poudarkom na prisotnost in značilnosti genov, vpletenih v toleranco na stres, zlasti na visoke koncentracije soli, ki jih vrste rodu Aureobasidium dobro prenašajo. Osredotočili smo se tudi na prisotnost biotehnološko pomembnih genov in opisali varietete kot nove vrste na podlagi razlik med genomi. Članek je bil objavljen v ugledni znanstveni reviji ustreznega raziskovalnega področja in je bil (tudi zaradi velikega pomena vrst Aureobasidium spp. v biotehnologiji, pa tudi v kmetijstvu in medicini) deležen večjega števila odzivov.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 3173711Endometrioza se pojavlja kar pri 10 % žensk v rodni dobi in pri 35 % do 50 % neplodnih žensk. Trenutno lahko endometriozo diagnosticiramo le invazivno s kirurško metodo laparoskopijo. Jasno je, da bi označevalci za neinvazivno diagnostiko bistveno prispevali k zgodnjemu odkrivanju te bolezni. Leta 2010 je skupina May s sodelavci sistematično pregledala področje perifernih biokemijskih označevalcev endometrioze in rezultate objavila v preglednem članku. V zadnjih letih pa smo bili z razvojem "omik" priče neslutenem napredku na področju identifikacije biokemijskih označevalcev. Članek vključuje pregled biokemijskih označevalcev, ki so jih v zadnjih 3 letih z različnimi pristopi identificirali v vzorcih krvi in urina. Predstavljeno je trenutno stanje biokemijskih označevalcev endometrioze, slabosti dosedanjih študij; članek pa zaključujejo predlogi za nadaljnje proučevanje označevalcev za neinvazivno diagnostiko.
F.21 Razvoj novih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov
COBISS.SI-ID: 31203545Genomic Medicine Alliance (Zveza za genomsko medicino) je globalna akademska raziskovalna mreža, ki si prizadeva za vzpostavitev in krepitev sodelovanja med različnimi interesnimi skupinami genomske medicine. Osredotoča se tudi na translacijo rezultatov znanstvenih raziskav v klinično prakso. Združuje strokovnjake iz različnih disciplin: informatike, farmakogenomiko, genomike javnega zdravja, etike v genomiki in zdravstvene ekonomike. Nadzorni odbor sestavlja 14-članski Mednarodni znanstveni svetovalni odbor 14 mednarodno priznanih znanstvenikov. Uradna revija je Public Health Genomics. Kratko- in srednjeročni cilj Genomic Medicine Alliance je usklajevanje in podpiranje raziskovalnih dejavnosti med razvitimi državami in državami v razvoju ter izobraževanje na področju genomske medicine.
D.03 Članstvo v tujih/mednarodnih odborih/komitejih
COBISS.SI-ID: 31771097