Več raziskav je pokazalo, da na odziv celic na določen tip nanodelcev vplivajo tako lastnosti nanodelcev (velikost, oblika, površinske lastnosti), kot tudi lastnosti celičnega tipa. Zato je pomembno, da nanodelce ovrednotimo v prisotnosti različnih celičnih tipov. V tej raziskavi smo uporabili magnetne nanodelce, prevlečene s plaščem iz poliakrilne kisline (PAA), ki smo jih izpostavili trem celičnim tipom: ovarijskim celicam kitajskega hrčka (CHO), celicam mišjega melanoma (B16) in primarnim humanim mioblastom (MYO). Pokazali smo, da nanodelci v vse tri linije vstopijo s procesoma makropinocitoze in s klatrini posredovane endocitoze, se znotraj celice nahajajo v različnih veziklih endolizosomalne poti in se v velikih količinah kopičijo v perinuklearni regiji celic. Kljub temu pa sta bili dinamika in hitrost privzema in odvisno od celičnega tipa. Nanodelci niso imeli toksičnih učinkov po 24 h inkubaciji in niso povzročili oksidativnega stresa, kljub temu pa smo po 96 h inkubaciji opazili zmanjšano viabilnost pri MYO celicah, ki je najverjetneje bila posledica velike količine privzetih nanodelcev. Opažene razlike v odgovorih celic na enake nanodelcev poudarjajo pomembnost testiranja nanodelcev na različnih celičnih tipih, saj nam to omogoči boljše napovedi posledic in vivo administracije nanodelcev. Študija je tudi potrdila uporabnost the ND za aplikacijo celičnega označevanja. IF = 4.383, članek ima 3 čiste citate Povezan dosežek: Nagrada za najboljši poster in predstavitev posterja na konferenci 7th Conference on Experimental and Translational Oncology, 2013, Portorož, Slovenia
COBISS.SI-ID: 31824089
Štetje celic je močno orodje za spremljanje številnih pojavov v biologiji in medicine, vendar pa je metoda časovno potratna, podvržena mnenju uporabnika in pogosto obravnavana kot neprijetno opravilo. Da bi pospešili proces štetja celic na slikah fluoresccenčnega mikroskopa smo v sodelovanju z dvema ekipama na Fakulteti za računalništvo in informatiko (UNI LJ) razvili dva programa za avtomatsko in polavtomatsko štetje celic: CellCounter in Learn123. Oba programa temeljita na istem setu algoritmov, vendar pa so parametri teh algoritmov pri CellCounter-ju močno optimizirani in predefinirani, medtem ko Learn123 s pomočjo genetskega algoritma parameter filtrov prilagaja vsakemu novemu setu učnih slik. CellCounte vsebuje tudi razširitev za štetje celic na prekrivajočih se slikah istega vidnega polja. Oba programa omogočata ponovljivo, zanesljivo, hitro in natančno detekcijo fluorescenčnih objektov in ju lahko uporabimo pri vrsti različnih bioloških in biotehnoloških poskusov, kjer se za vrednotenje specifičnih pojavov uporabljajo fluorescenčna barvila. Program smo validirali na seriji eksprementov analize toksičnosti nanodelcev in ugotovili odlično ujemanje s standardno ročno analizo. Avtomatska analiza nam omogoča izvedbo mnogo večjega števila eksperimentov analize nanotoksičnosti.
COBISS.SI-ID: 11059028