Prispevek opisuje validacijo nove MIK plošče za detekcijo občutljivosti bakterij C. difficile na antibiotike, ki so najbolj v uporabi za zdravljenje okužb s C. difficile v veterinarski in humani medicini. Oblikovali smo mikrotitrsko ploščo za ugotavljanje minimalne inhibitorne koncentracije sedemnajstih antibiotikov (Micronaut-S CD plošča MIC) (Merlin Diagnostika GmbH, Nemčija). Mikrotitrske plošče smo validirali tako, da smo preverili zanesljivost, primerljivost, ponovljivost in obnovljivost dobljenih rezultatov. Z ugotavljanjem zanesljivosti metode smo ugotovili, da je metoda popolnoma zanesljiva za vse antibiotike, ki so prisotni na plošči, z izjemo eritromicina, tigeciklina in linezolida. Primerjava rezultatov E-testov in Micronaut-S CD plošče MIC je izpostavila problem različnih proizvajalcev E-testov in jih zato za ovrednotenje primerljivosti s ploščami Micronaut-S CD MIC nismo uporabili. Ponovljivost plošč Micronaut-S CD MIC je za večino antibiotikov zelo dobra. Nekoliko večji razpon je bil pri amoksicilinu, klindamicinu, oksacilinu in trimetoprim/sulfametoksazolu. Rezultati obnovljivosti so pokazali, da je za dobre in obnovljive rezultate pomembna uporaba svežih bujonov Wilkins Chalgren, vzpostavitev vmesnikov, ki plošče med seboj nekoliko razmaknejo, in uporaba perforiranih folij (Sensititre® TREK, Anglija).
COBISS.SI-ID: 4178810
Prispevek opisuje občutljivost, prisotnost virulenčnih dejavnikov, klonsko porazdelitev in epidemiološke podatke proti meticilinu odporne bakterije Staphylococcus aureus, domačega okolja (CA-MRSA) v Sloveniji. Med 151 izolati MRSA smo pri 150 izolatih dokazali gen mecA in le pri enem izolatu gen mecC. Izolate MRSA smo uvrstili v 19 različnih klonov oz. klonskih skupin. Prevladujoči sekvenčni tipi so bili ST5 (26,4 %), ST45 (25,2 %), ST22 (10,6 %), ST398 (9,9 %), ST8 (5,9 %), ST7 (4,6 %), ST1 (3,9 %), ST152/377 (3,3 %), ST228 (2,6 %) in ST2883 (1,3 %). Sporadično smo dokazali naslednje sekvenčne tipe: ST6, ST9, ST30, ST72, ST88, ST111, ST130, ST225 in ST772. Gen za levkocidin Panton-Valentine (PVL) smo dokazali pri 13 (8,6 %) izolatih, ki so pripadali sekvenčnim tipom ST5, ST7, ST8, ST22, ST72, ST88, ST 152/377 in ST772.
COBISS.SI-ID: 32015833
Prispevek opisuje prevalenco, genotipe in antibiotično občutljivost izolatov C. difficile iz okoljskih vzorcev (prsti in luž). V članku prvi opišemo tudi dve filogenetsko zelo oddaljeni liniji C. difficile, predstavnike katerih najdemo večinoma v okolju, predvsem v prsti, in ki so se sporadično začeli pojavljati tudi v človeški populaciji.
COBISS.SI-ID: 512659256
V članku je opisana karakterizacija in raznolikost sevov, vključenih v mednarodno zbirko sevov bakterije C. difficile, izoliranih iz različnih živalskih vrst. Ugotovili smo veliko prekrivanje humanih in živalskih izolatov, kar še dodatno kaže na možnost medvrstnega, zoonotskega, prenosa bakterije C. difficile.
COBISS.SI-ID: 3852922
Prispevek opisuje dokaz prvega mecC-pozitivnega izolata MRSA, ki smo ga osamili pri bolnici, ki je bila hospitalizirana v severovzhodni regiji Slovenije. Pri pregledu nacionalne zbirke proti meticilinu odporne bakterije Staphylococcus aureus, domačega okolja (CA-MRSA), smo med 395 izolati, zbranimi med leti 2006 in 2013, dokazali dodatnih 6 mecC MRSA. MecC MRSA so pripadali spa tipom t843, t9397 in t10009, ter sekvenčnemu tipu ST130.
COBISS.SI-ID: 3854714