V naši raziskavi smo preučevali prisotnost enteričnih virusov pri divjadi in pri tem dokazali prisotnost rotavirusa skupine A pri srni. Z metodo NGS smo analizirali celoten virusni genom, ki je pri rotavirusih skupine A sestavljen iz 11 segmentov. Genetska kombinacija je bila G6-P[15]-I2-R2-C2-M2-A3-N2-T6-E2-H3. Filogenetska analiza segmenta VP7 je pokazala tesno povezavo z različnimi govejimi rotavirusnimi sevi, ki jih pogosto najdemo pri ljudeh. Pri analizi segmenta VP4 smo ugotovili večje razlike v primerjavi s sevi P [15], ki jih najdemo pri ovcah in kozah. Na podlagi tega lahko sklepamo, da so rotavirusi pri srni podobni tistim v drugih skupinah DS-1 rotavirusov in bi lahko predstavljali vir zoonotskega prenosa.
COBISS.SI-ID: 4157306
Kampilobakterioza je najpogosteje prijavljena bakterijska bolezen v EU, ki se prenaša s hrano. Namen raziskave je bil primerjati PCR v realnem času (qPCR) in digitalni PCR (dPCR) za kvantifikacijo bakterij Campylobacter jejuni v vzorcih vratne kože brojlerjev iz klavne linije v perutninski klavnici ter klasično števno metodo z gojenjem po standardu ISO 10272-2. Rezultati so pokazali, da je qPCR dobra metoda z zanesljivo mejo zaznavnosti (rLOD) in mejo kvantifikacije (LOQ) v območju teoretičnih mej. Obe meji rLOD in LOQ pa sta bili nad kritično mejo za stopnjo kontaminacije s C. jejuni na koži piščancev po priporočilih EFSA, zato predlagamo spremembo postopka v pripravi vzorcev (manj redčenja) pred izolacijo DNA. Opazili smo močno in statistično značilno korelacijo med qPCR in dPCR. Obe metodi PCR sta se značilno ujemali s klasično števno metodo, vendar je bila korelacija zmerna. Metoda dPCR je izkazovala značilen odklon proti precenjevanju števila, verjetno zaradi relativno velikega števila lažno pozitivnih zadetkov. Linearno dinamično območje je bilo pri obeh metodah PCR primerljivo, a se je metoda qPCR glede rutinske uporabe izkazala za bolj primerno.
COBISS.SI-ID: 4280442
Namen raziskave je bil ugotoviti dinamiko in dejavnike, ki vplivajo na izločanje Clostridium difficile (CD) na srednje velikih kmetijah krav molznic, ki so najpogostejša oblika kmetovanja v evropski uniji. Clostridium difficile je bil v blatu krav in telet, ter v okoljskih vzorcih iz 20 kmetij krav molznic tekom enega leta ugotovljen s qPCR in bakterijsko kulturo. Povprečna prevalenca med kmetijami je bila 10% za teleta in 35,7% za krave. Večina izolatov je bila CD ribotipa 033. Univariatna in multivariatna analiza dejavnikov vpliva je pokazala asociacijo med spremembo prehrane in večjo prevalenco CD pri kravah, medtem ko so bili dejavniki, ki so vplivali na višjo prevalenco pri teletih, sprememba prehrane, reja lisaste pasme goveda, mastitis in protimikrobna terapija. Raziskava nakazuje, da je CD pogosto prisoten na kmetijah krav molznic in da na povečano prevalenco vpliva bolj način vodenja kmetije in manj okolje. Srednje velike kmetije krav molznic trenutno ne prispevajo k večji incidenci CDI.
COBISS.SI-ID: 32539609
Fetalni hidrops je čezmerno kopičenje serozne tekočine v intersticiju in telesnih votlinah fetusa. Opisan je v humani in veterinarski medicini, vendar kljub več raziskavam njegova etiologija še ni popolnoma razjasnjena. Pljučna hipoplazija z anasarko (angl. pulmonary hypoplasia with/and anasarca syndrome, PHA) je redka prirojena napaka goveda, katere značilnosti so popolna nerazvitost (aplazija) ali slaba razvitost (hipoplazija) pljuč ter močen difuzen podkožni edem (anasarka). Doslej je bila ugotovljena pri teletih pasem dexter, galloway, maine-anjou in kratkorogem govedu. V članku opisujemo makroskopske in histopatološke spremembe in predstavimo analizo rodovnika prvih diagnosticiranih primerov PHA pri cikastem govedu. Morfološke spremembe, ugotovljene pri obeh teletih, so skladne z doslej opisanimi primeri PHA pri govedu. Po naših podatkih je to prvi opis PHA pri cikastem govedu, ki je naša edina avtohtona pasma govedi, ki je obenem tudi ogrožena. Analiza rodovnika in anamneza o parjenju v sorodstvu nakazujeta, da se napaka najverjetneje deduje na avtosomno recesivni način. Glede na fenotip bolezni pri cikastem govedu domnevamo, da mutacija gena verjetno povzroči motnjo v razvoju limfnih žil in posledično fetalni hidrops ter hipoplazijo pljuč, kar so deformacije, opisane pri PHA.
COBISS.SI-ID: 4157818
Beauvericin (BEA) je manj znan mikotoksin, ki ga večinoma proizvajajo glive Beauveria bassiana in Fusarium spp. Rezultati raziskave kažejo, da ima BEA nevrotoksične in miotoksične učinke, ki se prekrivajo v ozkem razponu koncentracij.
COBISS.SI-ID: 4093818