Raziskovani program Odnosi parazitskega obstajanja je multidisciplinaren program. Različni mikroorganizmi namreč parazitirajo pri različnih gostiteljih in pri tem sprožijo različne odzive, ki imajo za posledico spremembe v življenju gostitelja in življenskih okoliščinah za povzročitelja bolezni. Proučevanje posameznih mikroorganizmov, njihovih lastnosti in okoliščin v katerih živijo in v katerih okužijo človeka ali žival, tako predstavlja pestro množico dogodkov, ki jih s skupnim imenom imenujemo parazitska simbioza. Raziskovalna skupina Mikrobiologija in imunologija je v raziskovalnem obdobju 1999 - 2003 opravila obsežno delo, ki ga prikazujemo po sklopih: BAKTERIOLOŠKI SKLOP Spremljanje in nadzor občutljivosti bakterij, ki jih dokazujemo v dnevni diagnostiki in so pomembne za slovensko patologijo. Proučevanje vloge bakterij: Helicobacter pylori, Neisseria gonorrhoeae, E. coli, Pseudomonas aeruginosa, proti meticilinu rezistentne bakterije S. aureus, Borrelia burgdorferi, C. pneumoniae pri pojavu bolezni. VIROLOŠKI SKLOP Proučevanje molekularne ekologije in epidemiologije hantavirusov, rikecij in babezij. Proučevanje obstaja genetske heterogenosti znotraj posamezne vrste hantavirusov, neposredno dokazanih v vzorcih naravnih gostiteljev (gozdne in poljske miši). V ta namen ugotavljanje nukleotidnega zaporedja PCR amplikonov različnih delov hantavirusnega genoma. Dokaz prisotnost norovirusov (črevesni kalicivirusi, iz družine Caliciviridae) v Sloveniji. Izdelalava ustreznih elektronsko-mikroskopskih in molekularnih metod. Proučevanje razširjenosti človeškega herpesvirusa 6, ki je pri nas zelo razširjen, saj ima 80% oseb starejših od 20 let v krvi specifična protitelesa IgG, reaktivacije virusa pa so zelo pogoste. IMUNOLOŠKI SKLOP Ugotovljanje kvalitete imunskega odziva proti antigenom Borrelia burgdorferi s.l. in Borrelia afzelii, ki je odvisna od izraženosti antigenskih struktur na mikroorganizmih, ki smo jih uporabili za okužbo. Študij mehanizma nastanka membranskega glomerulonefritisa, ki je pogojen z nastankom imunskih kompleksov, ki posledično in vivo aktivirajo komplement. Povezava aktivacije komplementa z indukcijo apoptoze. Ugotovili, da je apoptoza eden od mehanizmov, ki prispevajo k nastanku bolezni. Merili količino vnetnih citokinov pri odraslih bolnikih s sepso in pri zelo bolnih novorojenčkih. Ugotavljali vlogo citokinov pri eksperimentalni okužbi z bakterijama Campylobacter jejuni in Lysteria monocytogenes ter s citomegalovirusom. Ugotovili, da so citokini pomembni dejavniki v patogenezi navedenih bolezni. PARAZITOLOŠKI SKLOP Z izpopolnjenimi in nekaterimi na novo vpeljanimi testi smo ugotovili razširjenost oz. nevarnost okužbe ljudi s Toxoplasma gondii (predvsem pri nosečnicah in očesnih bolnikih), Cryptosporidium parvum, Blastocystis hominis (pri bolnikih z drisko), ter določili in prvič opisali redka subtropska oz. tropska povzročitelja bolezni (Dirofilaria repens, Dermatobia hominis) vnesena v Slovenijo.