Filogenetski pristup analizi molekularne evolucije visoko varijabilnih virusa - koinfekcije, interakcija virusa i domaćina

Osnovni cilj projekta je ispitivanje molekularne evolucije visoko varijabilnih virusa, i to virusa humane imunodeficijencije (HIV) i koinficirajućih virusa, kao i hantavirusa, metodama filogenetske analize. Reprezentativnim uzorkovanjem ćemo utvrditi distribuciju HIV genotipova i preovlađujuće obrasce rezistencije na antiretrovirusne lekove (ARV) među pacijentima u Srbiji. Istražićemo detaljne karakteristike lokalne HIV epidemije generisanjem novih sekvenci i analizom varijabilnosti, filogenetskih parametara, migracije virusa, a posebno relacije sa koinficirajućim virusima. Ovo istraživanje će takođe dati preliminarne molekularne podatke o hantavirusima u cirkulaciji. Istražićemo prisustvo i svojstva hantavirusnih sekvenci u uzorcima animalnih rezervoara (glodara i insektivora) sa različitih lokacija u Srbiji, primenom univerzalnog PCR protkola za hantaviruse (pan-hanta PCR) i DNK sekvenciranjem. Metode filogenetske analize imaju rastući značaj u virusologiji povezujući bazična i klinička istraživanja kao i javno-zdravstveni aspekt, naročito u vezi varijabilnih virusa, značajnih pretećih agenasa, kao što su HIV i hantavirusi. Molekularni podaci dobijeni ovim istraživanjem biće kombinovani sa demografskim, kliničkim, ekološkim, biološkim podacima u okviru integrativnih baza podataka za pojedinačne izučavane patogene i oboljenja. One će pružiti značajan izvor podataka za sprovođenje složenih filogenetskih, filogeografskih, filodinamskih analiza.