Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Uporaba krompirjeve mikrobiote za modulacijo imunskega sistema krompirja in njegove rasti

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.03.00  Biotehnika  Rastlinska produkcija in predelava   

Koda Veda Področje
4.01  Kmetijske vede in veterina  Kmetijstvo, gozdarstvo in ribištvo 
Ključne besede
Krompir, varstvo rastlin, imunska signalizacija, epigenetika, endofiti, metagenom, prostorska transkriptomika, sistemska biologija, Potyviridae, koloradski hrošč
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
4.884,54
A''
1.240,78
A'
2.903,68
A1/2
3.571,63
CI10
7.803
CImax
271
h10
44
A1
18,16
A3
5,44
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 23. julij 2024; A3 za obdobje 2018-2022
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  354  10.002  8.649  24,43 
Scopus  365  10.924  9.457  25,91 
Raziskovalci (13)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  34130  dr. Anna Coll Rius  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  164 
2.  12688  dr. Kristina Gruden  Biotehnologija  Vodja  2021 - 2024  992 
3.  22492  dr. Barbara Kraigher  Biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  123 
4.  37409  dr. Maja Križnik  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  43 
5.  54678  Valentina Levak  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2021 - 2024  16 
6.  05993  dr. Ines Mandić-Mulec  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  646 
7.  29617  dr. Marko Petek  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  174 
8.  54306  Karmen Pogačar  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  22 
9.  18467  dr. Maruša Pompe Novak  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  293 
10.  26540  dr. Polonca Štefanič  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  204 
11.  50566  dr. Špela Tomaž  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  28 
12.  09864  dr. Magda Tušek Žnidarič  Biologija  Tehnični sodelavec  2021 - 2024  416 
13.  39320  dr. Maja Zagorščak  Interdisciplinarne raziskave  Raziskovalec  2021 - 2024  62 
Organizacije (2)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.478 
2.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  67.277 
Povzetek
Razumevanje kompleksnih interakcij med rastlinami in ostalimi organizmi v okolju je ključno za zagotavljanje razvoja bolj učinkovitega in trajnostnega pridelovanja poljščin. Patogeni in škodljivci lahko, kljub uporabi kemičnih pesticidov, povzročijo tudi do 80 % izgube pridelka. Po drugi strani pa lahko podskupina rastlinske mikrobiote, vključno z nekaterimi endofiti, z neposrednim spodbujanjem rasti rastlin ali s ojačanjem imunskega odziva pozitivno vpliva na sposobnosti rastlin. Mehanizmi interakcij rastline s patogenim so zelo podrobno poznani, malo pa je znanega o mehanizmih, ki se v rastlini sprožijo kot odziv na interakcijo z njenimi endofiti. V projektu bomo preučevali krompir, kot eno najpomembnejših poljščin, v interakciji z tremi mikroorganizmi, ki so bili v preliminarnih poskusih v našem laboratoriju izolirani in identificirani kot endofiti krompirja. Za boljše razumevanje interakcije krompir-endofit bomo povezali metode celične biologije, sintezne biologije in sistemske biologije ter preučevali lokalne in sistemske odzive. Po eni strani bomo preučevali fiziologijo endofita in situ, in planta ter na polju. Po drugi strani bomo z eksperimentalno zasnovo na več moleuklarnih nivojih, vključno s transkriptomiko in epigenomiko, v kombinaciji s konfokalnim slikanjem in mikrodisekcijo tkiva pridobili vpogled v prostorski odziv rastline na endofite. Da bi bolje razumeli, kako endofiti sistemsko vplivajo na imunski sistem krompirja, bomo testirali delovanje rastlin, koloniziranih z endofiti, v interakciji s krompirjevim virusom Y (PVY), ki velja za gospodarsko najpomembnejši virusni patogen krompirja, ter v interakciji s koloradskim hroščem, njegovim največjim insektnim škodljivcem. Na ta način bomo ocenili potencialne koristne učinke endofitov na razvoj obrambe pred patogeni in škodljivci. Podatki pridobljene v različnih fazah izvajanja projekta bomo integrirani in s pomočjo statističnega modeliranja in analizami omrežij postavili hipoteze o mehanizmih interakcije med rastlino in njenim endofitom. Hipoteze bodo potrjene v naknadno zasnovanih eksperimentih, prilagojenim naravi hipoteze. Predlagani projekt bo torej omogočil preboj v razumevanju interakcije krompirja in njegove mikrobiote ter usmeril raziskave k novim strategijam za trajnostno kmetijstvo.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno