Loading...
Projekti / Programi vir: ARRS

Toksini in biomembrane

Obdobja
Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.05.00  Naravoslovje  Biokemija in molekularna biologija   
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   

Koda Veda Področje
B000  Biomedicinske vede   

Koda Veda Področje
1.06  Naravoslovne vede  Biologija 
Ključne besede
Toksin, nevrotoksičnost, citotoksičnost, hemoragičnost, fosfolipaza A2, metaloproteinaza, tvorec pore,mehanizem delovanja, receptor, rak, apoptoza, lipidna signalizacija, filogenomika, horizontalni genski prenos,poligenske lastnosti, lipidna membrana, lipidni raft, holinesterazni inhibitor,biogoriva
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (37)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacij
1.  53554  Tadeja Bele  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2019 
2.  34328  Špela Bordon  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2015 - 2018 
3.  24290  dr. Matej Butala  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  224 
4.  11155  dr. Damjana Drobne  Biologija  Raziskovalec  2019  819 
5.  25974  dr. Cene Gostinčar  Biotehnologija  Raziskovalec  2018  292 
6.  32099  dr. Maja Grundner  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2017 - 2019  26 
7.  15639  dr. Gregor Gunčar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  247 
8.  50498  Adrijan Ivanušec  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2017 - 2019  22 
9.  38200  dr. Eva Jarc Jovičić  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2015 - 2019  56 
10.  34435  Minca Klobčar  Biologija  Mladi raziskovalec  2015 - 2016 
11.  35369  dr. Veno Kononenko  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2019  55 
12.  15587  Igor Koprivec    Tehnični sodelavec  2015 - 2019 
13.  07673  dr. Dušan Kordiš  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  214 
14.  00412  dr. Igor Križaj  Biokemija in molekularna biologija  Vodja projekta  2015 - 2019  694 
15.  50856  Beti Kužnik  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2018 
16.  18802  dr. Adrijana Leonardi  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  139 
17.  06994  dr. Peter Maček  Biokemija in molekularna biologija  Upokojeni raziskovalec  2015 - 2019  524 
18.  26460  dr. Mojca Mattiazzi Ušaj  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015  62 
19.  33136  dr. Miha Mikelj  Farmacija  Mladi raziskovalec  2015  18 
20.  35371  dr. Maruša Novak  Biotehnologija  Raziskovalec  2015 - 2018  34 
21.  33324  dr. Jernej Oberčkal  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2015  36 
22.  35372  dr. Davor Obradović  Naravoslovje  Mladi raziskovalec  2015 - 2017  14 
23.  35319  dr. Mojca Ogrizović  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2015 - 2017  33 
24.  33683  Nina Orehar    Tehnični sodelavec  2015 - 2019 
25.  37465  dr. Sabina Ott Rutar  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2016 - 2019  11 
26.  39090  dr. Anastasija Panevska  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2016 - 2019  45 
27.  51231  Anja Pavlin  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2018 - 2019  21 
28.  23575  dr. Miha Pavšič  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  176 
29.  20213  dr. Toni Petan  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  161 
30.  20653  dr. Uroš Petrovič  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  271 
31.  04570  dr. Jože Pungerčar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  318 
32.  37504  Neža Repar  Biologija  Mladi raziskovalec  2019  29 
33.  15328  dr. Kristina Sepčić  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  695 
34.  33137  dr. Matej Skočaj  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2018 - 2019  94 
35.  21553  dr. Jernej Šribar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  106 
36.  06905  dr. Tom Turk  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  596 
37.  15640  dr. Vera Župunski  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2019  166 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacij
1.  0103  Univerza v Ljubljani, Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo  Ljubljana  1626990  21.774 
2.  0106  Institut "Jožef Stefan"  Ljubljana  5051606000  84.932 
3.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  64.086 
Povzetek
Temeljni namen predlaganih raziskav programske skupine je pridobivanje novih spoznanj na področju človeške in živalske patofiziologije v korist izboljšanja zdravja ljudi in živali. Del svojih aktivnosti pa bomo posvetili tudi pridobivanju ekonomsko pomembnih bioproduktov s pomočjo mikroorganizmov. Poudarek naših raziskav v naslednjem obdobju bo na raziskavah toksinov, ki vplivajo na živčni in krvožilni sistem. Raziskave molekularnega mehanizma delovanja nevrotoksičnih sekretornih fosfolipaz A2 (sPLA2) bomo poglobili in razširili na uporabo teh molekul pri raziskavah novih poti prehajanja proteinskih molekul skozi celične membrane, pri regulaciji endo- in eksocitoze ter pri študiju delovanja in regulacije človeških ortologov v celičnem citosolu in v mitohondriju. Med pomembnimi cilji je osvetlitev možnosti zdravljenja nekaterih hudih nevrodegenerativnih bolezni. Na področju raziskav molekulske organizacije lipidnih mikro- in nanodomen bomo nadaljevali s preučevanjem specifičnih interakcij proteinskih tvorcev transmembranskih por z lipidnimi komponentami umetnih lipidnih in celičnih membran ter mehanizmi njihovega vpliva na morfologijo in funkcionalnost membran. Raziskave toksinov bomo razširili tudi na genotoksične citotoksine CdtABC, ki so bakterijski virulenčni dejavniki. Nadaljevali bomo raziskave farmakološko zanimivih snovi iz morskih organizmov, predvsem spužev, s protibakterijsko ali antiholinesterazno aktivnostjo, na osnovi katerih si obetamo razvoj nove vrste antibiotika in učinkovine za nadzor delovanja holinergičnega sistema. Preverili bomo tudi potencialne zaviralne učinke poli-alkilpiridinijevih soli iz spužve na delitev tumorskih celic. Raziskovali bomo vlogo presnove in signalizacije lipidov pri patofizioloških procesih pri človeku. Spremembe v lipidnem metabolizmu so namreč ključnega pomena pri najbolj perečih sodobnih boleznih, kot so metabolični sindrom, diabetes, kardiovaskularne bolezni in rak. Preučevali bomo vlogo encimov sPLA2 pri presnovi maščobnih kislin in kopičenju lipidov na ravni organizma. Pričakujemo, da bomo ugotovili pomembne povezave med preurejanjem membran, presnovo lipidov ter količino in sestavo lipidnih kapljic predvsem v tkivih in pri boleznih, kjer je prekomerno kopičenje maščob bistveno za patološke spremembe. Raziskovali in pojasnili bomo nastanek, evolucijo in funkcionalno diverzifikacijo različnih komponent v genomih prokariontov in evkariontov, evolucijo genomov po velikih ekoloških katastrofah ter nastanek in evolucijo proteinskih družin, ki so pridobile pomembne regulatorne vloge. Med obetavnimi alternativnimi viri za energetiko in kemijsko industrijo so lipidi, pridobljeni z mikroorganizmi iz lignocelulozne biomase. S pomočjo doma razvite tehnike določanja kavzalnih genov za poligenske lastnosti, kakršna je tudi sposobnost kopičenja lipidov, bomo preučevali sposobnost industrijskih sevov mikroorganizmov (pretežno kvasovk) za pretvorbo lignocelulozne biomase v, na primer, biodizel.
Pomen za razvoj znanosti
V naslednjem programskem obdobju načrtujemo raziskave, ki jih lahko razdelimo na toksinološke raziskave, raziskave tvorcev por, lipidov in zdravja, visokozmogljivostno genetiko kvasovk, analizo genomov in razvoj novih metod. Večina raziskav se navezuje na raziskave, ki smo jih izvajali v preteklem obdobju, jih bomo pa poglobili in razširili. Tako usmeritev upravičuje aktualnost raziskovalnih področij in njihov pomen za izboljšanje zdravja človeka in razvoj novih biotehnoloških postopkov, pa tudi visoka znanstvena relevanca naših dosedanjih rezultatov. Te smo uspeli objaviti tudi v najbolj prestižnih revijah s področja naravoslovnih znanosti, kot so Nature, MBE in PNAS. Naša dela so visoko citirana, njihov vpliv pa se kaže tudi v vabilih za predavatelje na konferencah najvišjega ranga, vabilih za pripravo preglednih člankov, povabilih v uredniške odbore znanstvenih revij in vabilih v znanstvene in organizacijske odbore največjih znanstvenih srečanj. Vse našteto odraža prepoznavnost in uveljavljenost naše skupine v mednarodnih znanstvenih krogih. Na področju toksinologije bomo še naprej usmerjeni v analizo molekularnih mehanizmov delovanja različnih komponent živalskih strupov, toksinov in drugih snovi, ki interferirajo z biološkimi membranami, z namenom razvoja novih molekularnih orodij za raziskave v fiziologiji in medicini, za razvoj inovativnih bioloških zdravil (antitrombotiki, citostatiki, analgetiki, imunotoksini) in obrambo pred strupi oz. toksini (detekcija in terapija, tako v povezavi z medicino kot z bioterorizmom). Toksini, ki jih bomo raziskovali, delujejo na različne načine in na različne tipe celic. Poudarek bo na študiju delovanja nevrotoksinov, citolizinov, zlasti tvorcev por, in komponent strupov, ki vplivajo na hemostazo. Pričakujemo, da bodo naši izsledki pomembno prispevali k raziskavam strukture in dinamike bioloških membran, usmerjanja proteinov v celicah ter pri iskanju novih poti za terapijo krvno-žilnih bolezni, kot so akutni srčni infarkt, pljučna embolija in kap, ter k pojasnjevanju in zdravljenju nevropatij, npr. Zellwegerjevega sindroma, Alzheimerjeve in Parkinsonove bolezni. Sekretorne fosfolipaze A2 so prožilci signalnih kaskad in pomemben dejavnik v metabolizmu lipidov pri sesalcih. Poznavanje uravnavanja teh procesov je ključnega pomena za razumevanje bolezni in motenj metabolizma, med njimi raka, diabetesa tipa 2 in debelosti. Raziskave na področju poligenskih lastnosti bodo omogočile nov preboj v genetiki in njeno širšo uporabo pri razvoju nove generacije industrijskih mikroorganizmov. Raziskave poligenskih lastnosti pri mikroorganizmih bodo uporabne tudi kot model za študij tovrstnih lastnosti pri človeku, tudi v medicini, saj je večina bolezni poligenskih. Raziskave različnih genomskih komponent (transpozicijski elementi, na novo nastali geni, funkcionalno diverzificirani geni in multigenske družine) so relevantne za številna pomembna vprašanja evolucijske genomike in regulatorne genomike. Omogočajo pojasnitev nastanka in evolucije različnih genomskih komponent ter pridobitev pomembnih bioloških vlog pri na novo nastalih genih in funkcionalno diverzificiranih proteinskih naddružinah.
Pomen za razvoj Slovenije
Raziskave programske skupine (PS) prispevajo v svetovno zakladnico znanja, nekatere med njimi pa imajo tudi uporabno vrednost. Med temi bomo nadaljevali z razvijanjem postopkov za pridobivanje bolj učinkovitih in varnih protistrupov, alternativnih protitumorskih sredstev, antikoagulantnih učinkovin in antitrombotikov. Razvijali bomo seve kvasovk s povečano sintezo lipidov za pripravo biogoriva. Nova generacija industrijskih mikroorganizmov bo v prihodnje igrala pomembno vlogo pri zagotavljanju energentov, ki bodo omogočili bistveno manjšo odvisnost od fosilnih goriv, in drugih bio-produktov. Zelo pomemben vidik naših raziskav je usvajanje najnovejših tehnologij, zlasti na področjih funkcijske genomike, genomske biologije in proteomike. V svojih laboratorijih nadgrajujemo in razvijamo raziskovalne metode, npr. postopek avtomatske kvantifikacije kolonij pri fenomiki kvasovk in metode za študij interakcij med proteini in lipidnimi membranami na osnovi SPR, sodelujemo pa pri razvoju novih bioinformacijskih orodij za analizo rezultatov genomskih poskusov. Naša PS predstavlja valilnico kadrov, ki so usposobljeni za delo z najnovejšimi tehnikami biokemije, farmakologije, molekularne biologije in genetike. Dejavnost PS je pomembna tudi za slovensko gospodarstvo: za nekatera na biotehnologiji temelječa mala podjetja (npr. Genialis, Bia in Acies Bio), kot tudi za naše veliko farmacevtsko podjetje Lek Sandoz, ki z nami intenzivno sodeluje. Naša dejavnost je pomembna za zdravstvo. Z ljubljanskim UKC nadaljujemo sodelavo pri razvoju novih sredstev za uravnavanje hemostaze pri človeku in za hematološko diagnostiko ter z raziskavami označevalcev antifosfolipidnega sindroma in razširjamo raziskave na klinično pomembne bakterijske patogene (npr. Aggregatibacter actinomycetemcomitans). Kot zelo pomembno ocenjujemo našo sodelavo pri vzgoji mladih raziskovalcev in študentov. Večina članov PS je intenzivno tako vpeta v pedagoško delo na dodiplomskem in podiplomskem nivoju, na UL, UM, UNG in na Mednarodni podiplomski šoli Jožefa Stefana. Nekateri naši člani poglobljeno sodelujejo pri prenovi univerzitetnih programov v skladu z bolonjsko reformo in pri (re)akreditacijah študijskih programov. S številnimi objavami v visoko citiranih mednarodnih znanstvenih revijah, predavanji in sodelavo pri organizaciji mednarodnih znanstvenih srečanj bo naša PS nedvomno prispevala k uveljavljanju slovenske znanosti, tega pomembnega dela nacionalne kulture in samobitnosti, v svetu. Skupina ima vzpostavljene številne mednarodne sodelave z uglednimi raziskovalci in institucijami po svetu in vedno teži k vzpostavljanju novih. Člani naše skupine bodo nadaljevali z opravljanjem nalog v mednarodnih strokovnih združenjih in uredniških odborih revij, kar bo dodatno krepilo nacionalno identiteto, prepoznavnost in ugled Slovenije v svetu. Del naših raziskav bo prispeval tudi k poznavanju in ohranjanju bogastva naravne dediščine naše avtohtone favne in mikrobiote in k razumevanju njene velike biološke raznovrstnosti.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2015, vmesno poročilo, zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2015, vmesno poročilo, zaključno poročilo
Zgodovina ogledov
Priljubljeno