Loading...
Projekti / Programi vir: ARRS

Genetsko ozadje odpornosti na mastitis

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.02.00  Biotehnika  Živalska produkcija in predelava   

Koda Veda Področje
B220  Biomedicinske vede  Genetika, citogenetika 

Koda Veda Področje
4.02  Kmetijske vede in veterina  Znanost o živalih in mlekarstvu 
Ključne besede
Mastitis, selekcijski podpis, variabilnost števila kopij, proteomska analiza, RNA sekvenciranje, bioinformatika
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (21)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacij
1.  29430  dr. Ivanka Cizelj  Biotehnologija  Raziskovalec  2016 - 2017  51 
2.  34506  dr. Manuela Čitar  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2016  19 
3.  05098  dr. Peter Dovč  Biotehnologija  Vodja projekta/programa  2016 - 2018  906 
4.  20135  dr. Alenka Erjavec Škerget  Reprodukcija človeka  Raziskovalec  2016 - 2018  148 
5.  24769  dr. Gregor Gorjanc  Živalska produkcija in predelava  Raziskovalec  2016 - 2018  460 
6.  13343  dr. Nadja Kokalj Vokač  Onkologija  Raziskovalec  2016 - 2018  435 
7.  07673  dr. Dušan Kordiš  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2016 - 2018  214 
8.  30811  dr. Danijela Krgović  Onkologija  Raziskovalec  2017 - 2018  70 
9.  00412  dr. Igor Križaj  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2016 - 2018  692 
10.  16361  dr. Tanja Kunej  Živalska produkcija in predelava  Raziskovalec  2016 - 2018  875 
11.  18802  dr. Adrijana Leonardi  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2016 - 2018  137 
12.  05008  dr. Mojca Narat  Biotehnologija  Raziskovalec  2016 - 2018  674 
13.  28505  dr. Jernej Ogorevc  Živalska produkcija in predelava  Raziskovalec  2016 - 2018  119 
14.  24298  dr. Irena Oven  Živalska produkcija in predelava  Raziskovalec  2016 - 2018  81 
15.  34333  dr. Tine Pokorn  Rastlinska produkcija in predelava  Tehnični sodelavec  2018  38 
16.  38858  Katja Skulj    Tehnični sodelavec  2018  13 
17.  20200  dr. Špela Stangler Herodež  Onkologija  Raziskovalec  2016 - 2018  234 
18.  15600  mag. Maja Šimaga    Tehnični sodelavec  2017 - 2018 
19.  15747  Andreja Zagorac  Reprodukcija človeka  Tehnični sodelavec  2016 - 2018  151 
20.  18205  dr. Boris Zagradišnik  Onkologija  Raziskovalec  2016 - 2018  257 
21.  32581  dr. Minja Zorc  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2016 - 2018  151 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacij
1.  0106  Institut "Jožef Stefan"  Ljubljana  5051606000  84.094 
2.  0334  Univerzitetni klinični center Maribor  Maribor  5054150000  21.280 
3.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  63.757 
Povzetek
Populacije, ki so bile zgodovinsko v stiku s povzročitelji bolezni, so pogosto razvile obrambne mehanizme – rezistenco, ki jim omogočajo preživetje kljub prisotnosti povzročiteljev bolezni. Zato predstavljajo lokalne populacije vir genetskega materiala, ki omogoča preživetje populacij v mejnih razmerah, na drugi strani pa tudi zalogo genov, ki bi jo lahko uporabili za izboljšanje zdravstvenega stanja v populacijah, ki teh obrambnih mehanizmov niso razvile. Mastitis predstavlja osrednji zdravstveni problem v čredah, ki so namenjene proizvodnji mleka. Ker so povzročitelji infekcij raznoliki in se hitro spreminjajo, je najučinkovitejši način izboljšanja odpornosti mlečne žleze krepitev prirojenega imunskega odziva. V naši raziskavi bomo z različnimi pristopi skušali odkriti genomske regije, ki so vzročno povezane z odpornostjo na mastitis. Uporabili bomo biološki material od avtohtone pasme goveda (cika) in visoko produktivne mlečne pasem oveda (holštajnsko frizijska) in od mlečne pasme koz, ki jih redimo pod konvencionalnimi in ekološkimi pogoji. Uporabili bomo različne metodološke pristope za odkrivanje kandidatnih regij v genomu: z GWAS analizo bomo skušali odkriti selekcijski podpis, ki bo odražal razlike v odpornosti na mastitis, s sekvenciranjem eksoma bomo iskali strukturne spremembe v genomu (rekombinacije, delecije, podvojitve), s sekvenciranjem transkriptoma celic v mleku in qPCR za posamezne kandidatne gene bomo izdelali ekspresijski profil somatskih celic v mleku in s proteomsko analizo bomo skušali identificirati izražanje pomembnih signalnih proteinov, ki uravnavajo prirojeno imunost v mlečni žlezi. Razumevanje molekularnih osnov za rezistenco na mastitis in molekularnih interakcij med povzročitelji bolezni in obrambnimi mehanizmi gostitelja je ključnega pomena za izboljšanje zdravja v mlečnih čredah. Te informacije bodo osnova za oblikovanje in izvajanje selekcijskih programov za izboljšanje zdravstvenega stanja v proizvodnih populacijah domačih živali, kar imenujemo »na molekularne markerje oprta selekcija«. Poseben pomen ima ta strategija v primerih, ko so ukrepi za zatiranje povzročiteljev bolezni neučinkoviti, bolezen pa povzroča veliko gospodarsko škodo. Mastitis, ki ga povzročajo različni patogeni (E. coli, S. aureus, S. uberis, vrusi, mikoplazme…) definitivno je tak primer bolezni, ki resno ogroža ekonomiko proizvodnje mleka in posredno tudi zdravje človeka.
Pomen za razvoj znanosti
Rezultati projekta bodo osvetlili molekularne interakcije med povzročitelji mastitisa in gostitelji in doprinesli k boljšemu razumevanju patogeneze mastitisa. Ker bomo proučevali različne seve povzročiteljev in odziv občutljivih in rezistentnih skupin gostiteljev domnevamo, da bomo lahko identificirali splošne dejavnike, ki vplivajo na dovzetnost za vnetje mlečne žleze, verjetno pa tudi splošne dejavnike, ki v proučevanih populacijah uravnavajo odpornost na okužbe. Pričakujemo, da bomo s kompleksnim pristopom lahko odkrili selekcijski podpis v genomu živali z različno občutljivostjo na mastitis in tako doprinesli k boljšemu mehanističnemu razumevanju delovanja prirojene imunosti v mlečni žlezi. Ker predstavlja mastitis pomemben vzrok za zmanjšanje ekonomičnosti proizvodnje mleka, bodo rezultati projekta in njihova uporaba v rejskih strategijah za zmanjšanje dovzetnosti za okužbe lahko pomembno doprinesli k izboljšanju ekonomike proizvodnje mleka in k boljši kakovosti končnega proizvoda.
Pomen za razvoj Slovenije
Projekt obravnava resen zdravstveni in gospodarski problem v proizvodnji mleka. Zaradi stroškov zdravljenja in zmanjšane kakovosti mleka so letne izgube v proizvodnih čredah ogromne in mastitis predstavlja najpomembnejši razlog za izločitev živali. Mastitis bistveno poslabša počutje živali in zmanjša kakovost mleka. Tako manj kakovostno mleko pogosto ni primerno za človeško prehrano in za nadaljnjo predelavo. Odkritje ustreznih genskih označevalcev za odpornost na mastitis bi omogočilo bolj učinkovito odbiro odpornejših živali in bi neposredno vodilo k izboljšanju zdravstvene situacije, boljšemu počitju živali in boljši kakovosti mleka. Zaradi usmeritve projekta v izboljšanje prirojene imunosti pričakujemo, da bi se s tem izboljšalo tudi splošno zdravstveno stanje in počutje živali. To bi imelo ugodne posledice na učinkovitost pridelave hrane in na splošno izboljšanje prehranske situacije ljudi.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Vmesno poročilo, zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Vmesno poročilo, zaključno poročilo
Zgodovina ogledov
Priljubljeno