Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje

Obdobja
Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.05.00  Naravoslovje  Biokemija in molekularna biologija   
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   
3.04.00  Medicina  Onkologija   

Koda Veda Področje
B0   Biomedicinske vede  B0  
P320  Naravoslovno-matematične vede  Nukleinske kisline, sinteza beljakovin 
B220  Biomedicinske vede  Genetika, citogenetika 
B200  Biomedicinske vede  Citologija, onkologija, kancerologija 
T490  Tehnološke vede  Biotehnologija 

Koda Veda Področje
1.06  Naravoslovne vede  Biologija 
Ključne besede
regeneracija tkiv, prekanceroze, onkogeneza, samomorilnost, anoreksija, homeostaza holesterola, keratini, celični cikel, genska ekspresija; bio-čipi, funkcijska genomika, transkriptom, proteom, bioinformatika; biofarmacevtiki, proteinski inženirstvo, nano-delci, r-DNA; CYP51, statini, citokini, 11beta-hidroksilaza; mitoza, mejoza, dvo-hibridni sistem; MLST
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (51)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  16104  dr. Apolonija Bedina Zavec  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  154 
2.  21407  dr. Sabina Berne  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  167 
3.  18325  dr. Simon Caserman  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  108 
4.  18622  dr. Nataša Debeljak  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  249 
5.  28559  dr. Urška Dermol  Kemijsko inženirstvo  Raziskovalec  2009 - 2013  17 
6.  25530  dr. Petra Draškovič  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2009  59 
7.  18992  dr. Martina Fink  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2013  128 
8.  20347  dr. Klementina Fon Tacer  Metabolne in hormonske motnje  Raziskovalec  2009 - 2012  127 
9.  06108  dr. Vladimira Gaberc-Porekar  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  220 
10.  18529  Dubravka Germ    Tehnični sodelavec  2009 - 2014 
11.  22406  dr. Maša Goršič Krisper  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009  21 
12.  32099  dr. Maja Grundner  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2010  36 
13.  30692  dr. Mateja Hafner  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  25 
14.  26055  dr. Gorazd Hribar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  49 
15.  21395  dr. Petra Hudler  Medicina  Raziskovalec  2009 - 2014  156 
16.  17275  Ana Marija Jesenko    Tehnični sodelavec  2009 - 2013 
17.  21352  dr. Peter Juvan  Reprodukcija človeka  Raziskovalec  2009 - 2014  163 
18.  28916  dr. Damjana Kastelic  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  33 
19.  24562  Helena Klavžar  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2009 - 2014 
20.  29388  dr. Nina Kočevar Britovšek  Naravoslovje  Raziskovalec  2009 - 2014  37 
21.  06135  dr. Radovan Komel  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2009 - 2014  1.054 
22.  21507  dr. Branka Korošec  Sistemi in kibernetika  Raziskovalec  2009 - 2013  61 
23.  29321  dr. Rok Košir  Srce in ožilje  Raziskovalec  2009 - 2014  90 
24.  37493  dr. Urša Kovač  Metabolne in hormonske motnje  Mladi raziskovalec  2014  25 
25.  00385  dr. Nada Kraševec  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  218 
26.  18847  Marjan Kužnik    Tehnični sodelavec  2010 - 2014 
27.  23473  dr. Ljerka Lah  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2013  60 
28.  17276  Jelka Lenarčič    Tehnični sodelavec  2009 - 2014 
29.  21241  dr. Ana Lenassi Zupan  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2012  16 
30.  15355  dr. Branimir Leskošek  Javno zdravstvo (varstvo pri delu)  Raziskovalec  2014  182 
31.  14305  dr. Mirjana Liović  Metabolne in hormonske motnje  Raziskovalec  2009 - 2014  148 
32.  33090  dr. Gregor Lorbek  Farmacija  Mladi raziskovalec  2010 - 2014  66 
33.  32116  dr. Metka Novak  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2009 - 2013  117 
34.  22581  dr. Mateja Novak Štagoj  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2013  20 
35.  22580  dr. Špela Peternel  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2012  42 
36.  12048  dr. Marjetka Podobnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  329 
37.  28382  dr. Uršula Prosenc Zmrzljak  Javno zdravstvo (varstvo pri delu)  Raziskovalec  2009 - 2014  91 
38.  22459  dr. Tadeja Režen  Nevrobiologija  Raziskovalec  2009 - 2014  246 
39.  34353  dr. Marija Rogar  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2011 - 2014  25 
40.  35360  dr. Sandra Ropret  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2012 - 2014  15 
41.  06013  dr. Damjana Rozman  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  896 
42.  24925  dr. Vanja Smilović  Biotehnologija  Tehnični sodelavec  2009  13 
43.  33735  dr. Neja Šamec  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2011 - 2014  82 
44.  28347  dr. Klemen Španinger  Onkologija  Raziskovalec  2009 - 2014  62 
45.  21684  Tea Tomšič    Tehnični sodelavec  2009 - 2014 
46.  30720  dr. Nina Trošt  Medicina  Raziskovalec  2009 - 2014  28 
47.  35357  dr. Žiga Urlep  Interdisciplinarne raziskave  Mladi raziskovalec  2012 - 2014  53 
48.  36368  dr. Marko Vidak  Medicina  Mladi raziskovalec  2013 - 2014  24 
49.  27742  dr. Alja Videtič Paska  Medicina  Raziskovalec  2009 - 2014  222 
50.  26574  dr. Matjaž Vogelsang  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2013  41 
51.  33509  Tina Zupančič  Biotehnologija  Tehnični sodelavec  2012 - 2014  25 
Organizacije (2)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  21.271 
2.  0381  Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta  Ljubljana  1627066  48.742 
Povzetek
Predlagani raziskovalni program 'Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje' združuje raziskave, ki so plod dela dveh dosedanjih programskih skupin: PO- 0527-0381 'Molekularna genetika in biotehnologija v biomedicinskih raziskavah' (MF UL, področje 1.05 Biokemija in molekularna biologija, 3.118 ur) in PS PO-0518-0104 'Genska tehnologija za fermentacijsko proizvodnjo biološko aktivnih beljakovin' (KI, področje 4.06 Biotehnologija, 3.684 ur). K programu se s svojimi raziskovalci pridružujejo tudi naslednje ustanove: LEK d.d., Inštitut za varovanje zdravja RS, Veterinarska fakulteta UL, Gastroenterološka klinika KC, Onkološki inštitut in Psihiatrična klinika. Gre za izrazito povezavo med raziskovalnim inštitutom, Univerzo in uporabniki iz farmacevtske industrije in zdravstvene sfere, ki smo jo že do sedaj uresničevali pri obeh omenjenih PS, oziroma gradili že več kot desetletje pred tem, sedaj pa bi jo radi postavili na višjo raven, kadrovsko in finančno nadgradili in tudi formalizirali. Opisana medinstitucionalna združitev pomeni tudi združevanje raziskav iz dveh raziskovalnih področij (Biokemija in molekularna biologija, Biotehnologija) ter poseg na tretje področje (Medicina). Združujeta se dve PS, ki na svojih področjih sodita med vodilne v Sloveniji: - PS Medicinske fakultete predstavlja jedro Medicinskega centra za molekularno biologijo, ki je v letih 1987-90 v Sloveniji uvedel raziskovalno področje medicinske molekularne genetike in raziskave človeškega genoma, še pred tem (v letih 1984-87) pa je bil med iniciatorji genske tehnologije (genskega inženirstva) pri nas. V okviru Centra in v sodelovanju s slovenskimi kliničnimi ustanovami so se usposobili številni vodilni raziskovalci, ki danes vodijo raziskovalno-diagnostične laboratorije za molekularno biologijo/genetiko v Sloveniji: na Ginekološki kliniki KC, na Inštitutu za patologijo MF UL, na Hematološki kliniki KC, na Fakulteti za farmacijo UL, na Oddelku za patologijo Onkološkega inštituta, na Inštitutu za sodno medicino MF UL in na Kriminološkem oddelku MNZ RS. Poleg temeljnih raziskav sta Center oz. njegova PS sodelovala pri vzpostavljanju diagnostičnih laboratorijev na partnerskih ustanovah in izvedla tudi prenose dosežkov v družbeno prakso, kar v tem primeru pomeni uvedbo molekularnih medicinskih diagnostik in genotipizacij s preiskavo genoma (cistična fibroza in hemofilija A v letih 1989-1993; genotipizacije limfomov od l.1994 naprej; genotipizacije za potrebe sodne medicine in kriminalistike od l.1996 naprej) in od l.2000 tudi razvoj metodologije za testiranje izvirnih učinkovin za LEK. V zadnjem času je bil Center med pobudniki ustanovitve Slovenske mreže za funkcijsko genomiko in je koordinator nacionalnega centra za izdelavo in analizo biočipov oz. za funkcijsko genomiko, ki je v izgradnji - v okviru konzorcija 14 slovenskih ustanov oz. raziskovalnih enot in farmacevtske industrije. - Druga skupina, to je PS Kemijskega inštituta, pa deluje v okviru mešane skupine raziskovalcev Kemijskega inštituta in tovarne LEK, ki so v zadnjih dveh desetletjih opravili biotehnološke raziskave oziroma pri njih sodelovali, katerih rezultati niso samo privedli do odmevnih publikacij in patentov, temveč so bili temelj za fermentacijsko proizvodnjo nekaterih zdravilnih učinkovin v LEKu, ki danes prinaša tudi velike finančne učinke tako tovarni LEK kot tudi slovenskemu proračunu. LEK s fermentacijsko proizvodnjo ergot-alkaloidov danes zaseda tretje mesto v svetu, zelo pomembna je tudi njegova proizvodnja klavulanske kisline, na obzorju pa je tudi prvo slovensko rekombinantno zdravilo, ki naj bi prišlo na trg do leta 2006. Na tem mestu velja omeniti, da je letos mednarodno podjetje Novartis prevzelo postopek pridobivanja rekombinantnega citokina, ki je bil razvit v okviru omenjene skupine LEK/KI, saj se je izkazalo, da je po lastnostih boljši od originatorjevega. Predlagani program 'Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje' je sestavljen iz dveh osnovnih
Pomen za razvoj znanosti
Funkcijska genomika je post-genomska veda, ki celico oz. njene biokemijske in patofiziološke fenomene razume kot integralen sistem in v tej luči preučuje hkratnost in prepletenost dogodkov, da bi v mreži interakcij poiskala molekulske kretnice dogajanj, razumela kompleksne biokemijske mehanizme življenja in patologije celice - in na teh osnovah ustvarjala nove diagnostične/terapevtske pristope ter razvijala nova zdravila z zelo natančnim, ciljanim delovanjem, brez nepotrebnih stranskih učinkov. Raziskave porgrama P1-0104 so bile usmerjene v ugotavljanje molekularnih vzrokov posameznih patologij, vendar obenem odpirajo poti za celostno iskanje tudi potencialno skupnih mehanizmov. V najnovejši literaturi je mogoče zaslediti rastoče število eksperimentalnih podatkov, ki navajajo na to, da si številne, na videz nepovezane večfaktorske bolezni kot so rak, diabetes, bolezni srca in ožilja, nevrodegenerativne bolezni in celo psihiatrične motnje, delijo skupna izhodišča kot npr. okvarjen metabolizem, spremenjen imunski oz. vnetni odgovor ali motnje v cirkadičnem ritmu. Izjemen napredek visoko zmogljivih analiznih metod ima globok vpliv na raziskave v biomedicini. Razkritje zaporedij številnih genomov, vključno s človeškim, molekularno biologijo preko funkcijske genomike nadgrajuje v sistemsko biologijo oz. medicino. Ogromna količina podatkov iz genomskih raziskav zahteva tesno sodelovanje med raziskovalci, ki eksperimentalne podatke producirajo, in bioinformatiki, ki podatke lahko analizirajo in modelirajo. Bolezni človeka začenjamo razumeti kot dinamično motnjo zapletenih integriranih genetskih, molekulskih in celičnih ritmičnih mrež, ki so senzorično in interaktivno povezane z okoljem. Omenjeni premik iz ustaljenega pogleda na medicino in njene raziskave, ki so ga omogočile zmogljive post-genomske tehnologije, bo tudi temeljna gonilna sila našega raziskovalnega dela v prihodnje. Z raziskavami razvijamo platformo za celostno preučevanje kompleksnih večfaktorskih bolezni (od genomike, transkriptomike in proteomike do sistemske bioinformatske analize podatkov) in posledično načrtovanje novih diagnostičnih in terapevtskih pristopov. Znanja in uvedene metode bodo na voljo za ustrezno obravnavo katerekoli kompleksne bolezni, obenem pa bodo tudi izhodišče za oblikovanje novih »spin-off« podjetij (nano-protitelesa; diagnostična orodja; terapevtiki; bioinformacijske obdelave). Znanstvena spoznanja iz omenjenih raziskav spadajo v kategorijo temeljnih znanstvenih spoznanj s področja biokemije in molekularne biologije, funkcijske genomike in matematičnih pristopov, kar skupaj vodi do sistemske medicine, ki bo imela v naslednjem desetletju velik vpliv na javno zdravstvo in ekonomijo.
Pomen za razvoj Slovenije
Program P1-0104 »Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje« je potekal v treh zaporednih obdobjih: 1999 – 2003; 2004 – 2008; 2009 – 2014. Združeval je raziskovalni skupini Medicinske fakultete (MF) in Kemijskega inštituta (KI) in je bil leta 2004 s strani ARRS tudi uvrščen med najuspešnejše programe. Uvedel je molekularno diagnostiko v slovensko medicino in gensko analizo v slovensko forenziko in bil nosilec sodelovanja s farmacevtsko družbo LEK. Imel je ključno vlogo pri izgradnji Sandoz-Lekovega centra Biofarmacevtika in bil nosilec prvega slovenskega postopka za proizvodnjo biološkega zdravila (v obdobju po letu 2009 sprejet za globalno proizvodnjo v Sandozu). Bil je pobudnik Slovenske mreže za funkcijsko genomiko, ki je postavila nacionalni infrastrukturni center za funkcijsko genomiko in bio-čipe. Raziskave zadnjega obdobja (2009-2014) pomenijo premik v raziskovanje kompleksnih bolezni, z novimi post-genomskimi pristopi v raziskovanju in znanstvenemu razmišljanju, ki omogočajo nov, celosten vpogled v dejavnike tveganja ter mehanizme razvoja in napredovanja kompleksnih patologij. Z odkrivanjem novih genetskih in funkcijskih povezav in vloge molekulskih tarč program daje osnove za razvoj novih diagnostičnih in terapevstskih postopkov ter usmerjenih zdravil in s tem tudi njihov neposreden prenos v klinično prakso. Razvoj pristopov k racionalnejši farmakoterapiji odpira poti, ki bodo omogočale bolniku prilagojeno zdravljenje. Nov post-genomski način razmišljanja se seveda odraža tudi v sodobnem usposabljanju zdravnikov in raziskovalcev na ravni dodiplomskega in podiplomskega univerzitetnega študija.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Zgodovina ogledov
Priljubljeno