Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Molekularna biotehnologija: od dinamike bioloških sistemov do aplikacij

Obdobja
Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   
1.05.00  Naravoslovje  Biokemija in molekularna biologija   
1.09.00  Naravoslovje  Farmacija   
3.01.00  Medicina  Mikrobiologija in imunologija   

Koda Veda Področje
T490  Tehnološke vede  Biotehnologija 
B230  Biomedicinske vede  Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija 
B510  Biomedicinske vede  Infekcije 
B725  Biomedicinske vede  Diagnostika 
P310  Naravoslovno-matematične vede  Beljakovine, encimologija 

Koda Veda Področje
3.04  Medicinske in zdravstvene vede  Medicinska biotehnologija 
Ključne besede
molekularne osnove bolezni, lipopolisaharid, celični receptorji, signalizacija, sepsa, biosenzorji, protitelesa, biotehnologije, prioni, antimikrobne učinkovine, primarni metabolizem, strukturna biologija, molekularno modeliranje
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (59)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  33206  dr. Darjan Andrejc  Biologija  Mladi raziskovalec  2010 - 2014  19 
2.  29065  Matevž Avbelj  Biotehnologija  Tehnični sodelavec  2009 - 2011 
3.  29495  dr. Monika Avbelj  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  55 
4.  25835  dr. Tanja Bagar  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2009  256 
5.  14360  dr. Mojca Benčina  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  392 
6.  33205  dr. Sabina Božič Abram  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2010 - 2014  42 
7.  18675  Robert Bremšak    Tehnični sodelavec  2009 - 2014  11 
8.  37380  dr. Karen Butina Ogorelec  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2014  33 
9.  37381  dr. Miša Mojca Cajnko  Kemijsko inženirstvo  Tehnični sodelavec  2014  51 
10.  25730  dr. Anja Colja Venturini  Farmacija  Raziskovalec  2009 - 2014  17 
11.  24259  dr. Slavko Čeru  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2014  55 
12.  05236  dr. Vladka Čurin Šerbec  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2009 - 2014  261 
13.  33301  Tibor Doles  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2011 - 2014  41 
14.  30848  dr. Ota Fekonja  Farmacija  Raziskovalec  2010 - 2013  25 
15.  34529  dr. Vida Forstnerič  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2011 - 2014  40 
16.  07731  dr. Jožefa Friedrich  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2012  184 
17.  32254  dr. Rok Gaber  Biotehnologija  Tehnični sodelavec  2010 - 2014  52 
18.  31950  dr. Petra Galer  Kemija  Raziskovalec  2014  27 
19.  28558  dr. Jernej Gašperšič  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2010  62 
20.  36426  dr. Anja Golob Urbanc  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2013 - 2014  32 
21.  17915  dr. Helena Gradišar  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  130 
22.  23563  dr. Iva Hafner Bratkovič  Nevrobiologija  Raziskovalec  2009 - 2014  210 
23.  15978  dr. Katrina Hartman  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2009 - 2014  43 
24.  28881  dr. Karolina Ivičak Kocjan  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  54 
25.  06628  dr. Roman Jerala  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2009 - 2014  1.189 
26.  36853  dr. Lucija Kadunc Polajnar  Nevrobiologija  Mladi raziskovalec  2014  43 
27.  34520  dr. Vid Kočar  Farmacija  Mladi raziskovalec  2011 - 2014  35 
28.  31854  dr. Tomaž Koprivnjak  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2011  26 
29.  25973  dr. Simon Koren  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2010  88 
30.  28420  dr. Miha Kosmač  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2011 - 2014  13 
31.  35344  dr. Valerija Kovač  Medicina  Mladi raziskovalec  2012 - 2014  20 
32.  29494  dr. Alenka Kužnik Krajnik  Farmacija  Raziskovalec  2009 - 2012  19 
33.  34069  dr. Duško Lainšček  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2012 - 2014  148 
34.  34252  Tina Lebar  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2011 - 2014  67 
35.  09354  dr. Matic Legiša  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  272 
36.  33323  dr. Anja Lukan  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2010 - 2014  17 
37.  17917  dr. Andreja Majerle  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  92 
38.  21426  dr. Mateja Manček Keber  Farmacija  Raziskovalec  2009 - 2014  159 
39.  23939  dr. Martina Mohorčič  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  30 
40.  32114  dr. Jerneja Mori  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  39 
41.  29496  Blaž Nemec  Kemija  Mladi raziskovalec  2009 - 2011  23 
42.  29991  Alja Oblak  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2009 - 2014  60 
43.  17280  Darija Oven    Tehnični sodelavec  2009 - 2014 
44.  26163  dr. Gabriela Panter  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  45 
45.  37589  dr. Tina Tinkara Peternelj  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2014  39 
46.  26500  dr. Nina Pirher  Biotehnologija  Raziskovalec  2009 - 2014  42 
47.  32113  dr. Jelka Pohar  Biotehnologija  Raziskovalec začetnik  2009 - 2014  96 
48.  12060  dr. Primož Pristovšek  Kemija  Raziskovalec  2009 - 2014  135 
49.  26501  dr. Nuša Resman  Farmacija  Raziskovalec  2009 - 2012  13 
50.  31915  dr. Nejc Rojko  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec začetnik  2014  29 
51.  33201  dr. Anže Smole  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2010 - 2014  74 
52.  29086  Boštjan Smrekar  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2009 - 2014  17 
53.  29490  mag. Andreja Šmerc  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2009 - 2010  10 
54.  34253  Jernej Turnšek    Tehnični sodelavec  2011 - 2012  22 
55.  26515  dr. Aleksandra Usenik  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2009 - 2010  54 
56.  25436  dr. Jožica Vašl  Naravoslovje  Raziskovalec  2009 - 2014  37 
57.  21335  dr. Tanja Vranac  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2009 - 2014  40 
58.  28563  dr. Mojca Zelnikar  Farmacija  Mladi raziskovalec  2009  15 
59.  25437  dr. Mateja Zorko Kern  Farmacija  Raziskovalec  2009 - 2012  40 
Organizacije (2)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  20.916 
2.  0311  Zavod Republike Slovenije za transfuzijsko medicino  Ljubljana  5053960  1.736 
Povzetek
V vedah o življenju prihaja do prehoda od molekularnega na sistemski nivo, kar obeta razvoj nove kvalitete v razumevanju kompleksnih bioloških sistemov kot sta imunski in metabolni sistem. Izhodišče programa je povezovanje osnovnih raziskav na mednarodno primerljivem znanstvenem nivoju z razvojem njihovih aplikacij oz. na vsebinah raziskav, ki obetajo potencialno uporabnost, predvsem na področju skrbi za zdravje. Poudarek programa je na razumevanju odgovora človeškega organizma na bakterijske infekcije in mehanizma konformacijskih bolezni na molekularnem nivoju in na razumevanju delovanja metabolizma mikroorganizmov usmerjenega v povečanje produkcije različnih farmacevtsko pomembnih produktov. V raziskavah receptorjev za LPS bomo raziskovali izven-celične (MD-2, TLR4 in CD14) kot tudi na znotraj-celične receptorje. Razumevanje interakcij na molekulskem nivoju lahko vodi k novim spojinam, s katerimi bomo lahko nevtralizirali prekomeren imunski odziv. Cilj teh raziskav je pojasnitev biokemijske specifičnosti t.i. PAMP receptorjev, to je receptorjev, ki prepoznavajo molekularne vzorce patogenih mikroorganizmov. Na osnovi povezave med strukturo in biološko aktivnostjo (SAR) bomo razvili nove (lipo)peptide in ugotovili razlike v vezavi na bakterijske membrane in njihovi selektivnosti. Na področju skrbi za zdravje raziskujemo tudi bolezni povezane s konformacijskimi spremembami proteinov, predvsem TSE (prenosljive spongiformne encefalopatije). Monoklonska protitelesa so se uveljavila kot nepogrešljivo diagnostično orodje in kot potencialna zdravila. S kombiniranjem imunokemije z metodami proteinske in strukturne biokemije smo naredili prvi korak pri analizi specifičnosti protiteles, ki prepoznajo patogeno obliko prionskega proteina (PrPSc), povezano z Creutzfeldt-Jakobovo boleznijo. Ta in druga orodja nam bodo omogočila izboljšati detekcijo in zgodnjo diagnostiko bolezni in po drugi strani prispevati k pojasnitvi mehanizma infektivnosti TSE. Program vključuje tudi raziskave metabolizma industrijskih mikroorganizmov. Z raziskavami primarnega metabolizma ter vplivom sprememb v okolju na regulacijo metabolizma se bomo osredotočili na 6-fosfofrukto-1-kinaza (pfkA), pri kateri smo ugotovili, da se njene encimske lastnosti močno spremenijo med procesom post-translacijske modifikacije. Okrajšan gen za sintezo bolj aktivnega encima nameravamo prenesti v drug komercialno pomemben mikroorganizme. Za opazovanje celičnih sprememb in vivo predvsem pri evkariontih je potreben tudi razvoj novih znotrajceličnih senzorjev na osnovi fluorescenčnih proteinov, s katerimi bomo lahko spremljali strukturo in dinamiko celičnih funkcij. Študij signalizacije v mikroorganizmih bomo usmerili na analizo Ca++, cAMP in pH znotraj živih celic.
Pomen za razvoj znanosti
Člani programske skupine so pomembno sooblikovali razvoj sintezne biologije v svetu v zadnjem času. Koncept, ki so ga vpeljali je načrtovana modularnost, kar pomeni uporabo domen, ki se lahko pripravijo v številnih variantah, s pomočjo katerih lahko pripravimo nove modularne strukture ali uvedemo celično logiko. Tovrstni modularni gradbeni elementi so dimerne obvite vijačnice za pripravo novih tipov proteinskega zvitja katerega definira topologija, kar je najbrž najbolj izviren prispevek te skupine k znanosti v zadnjem obdobju. Priprava proteinskega tetraedra je doživela izjemen odmev v znanstveni skupnosti. Druga skupina modularnih gradnikov so DNA vezalni proteini na osnovi TALE domen, s pomočjo katerih smo pripravili ortogonalna NOR vrata ter bistabilno gensko stikalo. Dodatno lahko izpostavimo prispevke k dizajnu biosintetskega ogrodja na snovi DNA in DNA vezalnih domen, ki je izboljšala produkcijo treh reakcij in bila deležna posnemanja.
Pomen za razvoj Slovenije
Program Molekularna biotehnologija je pomemben za Slovenijo ker se uvršča med vodilne skupine na področju raziskav naravne imunosti in sintezne biologije. Program omogoča stik s svetovnim vrhom na teh dveh področjih, ki sta pomembni tudi za zdravje ter kot vedno bolj pomembno tehnološko področje. Pomembna je vloga programske skupine za šolanje usposobljenih raziskovalcev, ki so sposobni reševati zahtevne znanstvene ter razvojne probleme. Uspehi skupine na področju znanost ter visokošolskega izobraževanja ter intenzivna mednarodna vpetost pomenijo promocijo Slovenije kot razvite države ter pomembnega partnerja. Sodelovanje s podjetji na področju visoke tehnologije omogoča prenos znanstvenih dosežkov v industrijsko uporabo s partnerji v Sloveniji ali po svetu. Skupina je pomembna tudi za promocijo znanosti kot ključnega dejavnika uspešnega razvoja ter del intelektualne identitete v Sloveniji na nivojih od srednješolcev, njihovih mentorjev, študentov, raziskovalcev, politike ter širše javnosti.
Avdiovizualni viri (1)
št. Naslov (s povezavo na video) Dogodek Vir
1. Molekularna biotehnologija: od dinamike bioloških sistemov do aplikacij    Video predstavitev raziskovalnega programa 
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Zgodovina ogledov
Priljubljeno