Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Odnosi parazitskega obstajanja

Obdobja
Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
3.01.00  Medicina  Mikrobiologija in imunologija   

Koda Veda Področje
B230  Biomedicinske vede  Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija 

Koda Veda Področje
3.01  Medicinske in zdravstvene vede  Temeljna medicina 
Ključne besede
bakterije, virusi, paraziti, molekularna epidemiologija, ekologija, patogeneza, genetska variabilnost
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (71)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  10331  dr. Tatjana Avšič-Županc  Mikrobiologija in imunologija  Vodja  2015 - 2021  804 
2.  38245  dr. Katarina Benulič  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2015 - 2019 
3.  24350  dr. Tjaša Cerar Kišek  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  208 
4.  25990  dr. Vesna Cvitković Špik  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2016  40 
5.  29943  Darja Dolenc    Tehnični sodelavec  2015 - 2021 
6.  54660  Anja Erbežnik  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2020 - 2021  12 
7.  05320  dr. Bratko Filipič  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015  267 
8.  25986  dr. Kristina Fujs Komloš  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  79 
9.  25985  Marja Furlan    Tehnični sodelavec  2015 - 2017  19 
10.  55847  Grega Gimpelj Domjanič  Medicina  Mladi raziskovalec  2021 
11.  28445  dr. Urška Glinšek Biškup  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  36 
12.  10514  Vesna Golob  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2015 - 2020 
13.  39128  dr. Gašper Grubelnik  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2021  32 
14.  38525  dr. Lea Hošnjak  Medicina  Raziskovalec  2016 - 2021  117 
15.  10337  dr. Alojz Ihan  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  1.462 
16.  53472  Larisa Janžič  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2019 - 2021  26 
17.  18063  Mateja Jelovšek    Tehnični sodelavec  2015 - 2021  30 
18.  25987  dr. Samo Jeverica  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2020  192 
19.  29997  dr. Monika Jevšnik Virant  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  51 
20.  05381  dr. Darja Keše  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  268 
21.  28601  dr. Nataša Knap Gašper  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  77 
22.  23430  dr. Boštjan Kocjan  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015  231 
23.  29937  dr. Rok Kogoj  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  61 
24.  32819  Marko Kolenc    Tehnični sodelavec  2015 - 2021  41 
25.  25991  dr. Andreja Nataša Kopitar  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  191 
26.  07264  dr. Srečko Koren  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2017  226 
27.  30696  dr. Miša Korva  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  188 
28.  55622  Kaja Kotnik    Tehnični sodelavec  2021 
29.  54664  Katarina Kovač  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2020 - 2021 
30.  10905  Veronika Križan-Hergouth  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2015 - 2021  73 
31.  54554  dr. Maja Lunar  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2020 - 2021  83 
32.  50691  dr. Miša Marušić  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2017 - 2021  15 
33.  18993  dr. Tadeja Matos  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  186 
34.  36669  dr. Polona Maver Vodičar  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2017 - 2021  95 
35.  35029  dr. Tina Mikuletič  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2015 - 2020  59 
36.  12193  dr. Manica Mueller Premru  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2020  309 
37.  54479  Aljoša Obreza    Tehnični sodelavec  2020 - 2021 
38.  39125  mag. Miha Oražem  Medicina  Mladi raziskovalec  2016  85 
39.  35359  dr. Anja Oštrbenk Valenčak  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  106 
40.  15902  dr. Miroslav Petrovec  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  450 
41.  31399  dr. Mateja Pirš  Medicina  Raziskovalec  2015 - 2021  212 
42.  55591  Katka Pohar    Tehnični sodelavec  2021  18 
43.  11622  dr. Mario Poljak  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  1.223 
44.  08755  dr. Mateja Poljšak-Prijatelj  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2020  234 
45.  35044  dr. Katarina Resman Rus  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  54 
46.  13296  dr. Eva Ružić-Sabljić  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  552 
47.  54480  Martin Sagadin    Tehnični sodelavec  2020 - 2021  37 
48.  24279  dr. Ana Saksida  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2018  49 
49.  14504  dr. Katja Seme  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  708 
50.  05382  dr. Saša Simčič  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  152 
51.  51956  dr. Lucijan Skubic  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2018 - 2021  15 
52.  27608  dr. Miha Skvarč  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2018  93 
53.  55839  Jan Slunečko  Medicina  Mladi raziskovalec  2021  10 
54.  23519  dr. Andrej Steyer  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  214 
55.  29475  dr. Sanja Stopinšek  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  42 
56.  25989  dr. Katja Strašek Smrdel  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  67 
57.  52539  dr. Alen Suljič  Nevrobiologija  Tehnični sodelavec  2021  22 
58.  53735  Mateja Škamperle  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2021 
59.  22460  dr. Barbara Šoba Šparl  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  136 
60.  37495  dr. Anja Šterbenc Železnik  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  74 
61.  26068  dr. Nataša Švent Kučina  Medicina  Tehnični sodelavec  2015 - 2021  54 
62.  53475  Tjaša Teržan  Mikrobiologija in imunologija  Mladi raziskovalec  2019 
63.  38488  Rok Tomazin    Tehnični sodelavec  2021  59 
64.  36377  dr. Miha Tome  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2016 - 2017  32 
65.  29734  Robert Tratar    Tehnični sodelavec  2018 - 2021 
66.  54478  Tina Triglav  Mikrobiologija in imunologija  Tehnični sodelavec  2021  43 
67.  25433  dr. Tina Uršič  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2015 - 2021  71 
68.  54481  Ivana Velimirović    Tehnični sodelavec  2020 - 2021  17 
69.  51960  dr. Samo Zakotnik  Medicina  Mladi raziskovalec  2018 - 2021  29 
70.  38244  dr. Tomaž Mark Zorec  Medicina  Raziskovalec  2015 - 2021  41 
71.  29733  Uroš Žižmund    Tehnični sodelavec  2015 - 2021 
Organizacije (1)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0381  Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta  Ljubljana  1627066  48.742 
Povzetek
Programsko skupino sestavljajo različni sklopi medicinske mikrobiologije, ki jih povezujejo raziskave molekularne epidemiologije in ekologije ter proučevanje genetskih raznolikosti in patogeneze določenih mikroorganizmov s katerimi želimo ugotoviti načine prenosa in širjenje ter dejavnike, ki vplivajo na nastanek in potek bolezni ter zdravljenje. SKLOP BAKTERIOLOGIJA: proučevali bomo mehanizme odpornosti, molekularno epidemiologijo patogenih bakterij in patogenezo okužb. Pri proti karbapenemom odpornih G- bacilih bomo poleg karbapenemaz iskali tudi spremembe na porinih. Pri ESBL enterobakterijah bomo proučevali razširjenost posameznih virulentnih klonov, določali encime in ugotavljali potek kolonizacije pri nosilcih. Pri CA-MRSA bomo proučevali virulentne dejavnike in genetsko raznolikost ter klone, ki imajo nove zapise za odpornost. Proučevali bomo genetsko heterogenost in patogenezo okužb z M. pneumoniae. SKLOP IMUNOLOGIJA: osredotočili se bomo na mikrobno patogenezo in značilnosti okužb pri imunsko-oslabljenem (IO) gostitelju. Naš cilj je proučiti posebne imunske značilnosti pri IO gostiteljih in imunopatogenetske značilnosti najpogostejših povzročiteljev okužb, ki se pojavljajo pri IO bolnikih (glivičnih, praživalskih, bakterijskih in virusnih). SKOP VIROLOGIJA: pri proučevanju malignih tumorjev bomo skušali ugotoviti ali obstajajo podtipske različice HPV6/11, ki so značilno povezane z nastankom malignih tumorjev oz ali je nastanek teh tumorjev povezan z genetskim ozadjem posameznika in/ali integracijo virusa v značilna področja človeškega genoma. Na področju enteričnih virusov se bomo osredotočili na spremljanje rotavirusnih različic genotipov in na molekularno epidemiologijo norovirusov, ki periodično povzročajo obširnejše epidemije. Pri raziskavah respiratornih virusov želimo z molekularno biološkimi metodami pri dobro klinično opredeljenih bolnikih ugotoviti ali na pojavnost in težo klinične slike vplivajo zgolj določeni sevi respiratornih virusov. Pri raziskavah virusnih hemoragičnih mrzlic (VHM) nameravamo poglobljeno proučiti patogenezo z ugotavljanjem stopnje aktivacije naravnega imunskega odziva, predvsem odziva s strani interferonov tipa I in raziskovanjem genetsko pogojenih dejavnikov imunskega odgovora. SKLOP ZOONOZE: nameravamo opredeliti riziko za razširjanje in pojavljanje zoonotičnih agensov, zato se bomo usmerili v razvijanje sodobnih diagnostičnih metod, sistematično pregledovanje gostiteljev in prenašalcev ter izdelavo napovednih zemljevidov. Proučevali bomo razširjenost vektorsko prenesenih zoonotičnih agensov, tako bakterijskih: borelije, leptospire, erlihije/anaplazme, francisele, kot virusnih: KMEV, HTNV, WNV, flebovirusi in parazitskih: Giardia sp.. nameravamo vzpostaviti nacionalno biobanko izolatov, ki bi omogočila natančno genotipizacijo mikroorganizmov, ter tako boljšo opredelitev njihovega zoonotskega potenciala.
Pomen za razvoj znanosti
SKLOP BAKTERIOLOGIJA Pri proti karbapenemom odpornih po gramu negativnih bacilih je mehanizem spremembe porinov slabo poznan in ga je potrebno bolj raziskati. Rezultati raziskave o poteku kolonizacije z enterobakterijami, ki izločajo ESBL bodo pojasnili trajanje, predilekcijska mesta in dejavnike, ki vplivajo na trajanje kolonizacije. Z določitvijo virulentnih klonov E. coli ESBL in encimov bomo razjasnili vzrok za povečevanje teh okužb. S proučitvijo CA-MRSA iz zbirke slovenskih izolatov bomo ugotovili, ali so le-te v porastu, kakšne so razlike med sevi, ki povzročajo okužbe in tistimi, ki samo kolonizirajo in ali je že prišlo do vnosa v bolnišnice. S proučevanjem patogeneze M. pneumoniae bomo odgovorili na vprašanje, ali so razlike v virulenci in spodbujanju tvorbe citokinov med posameznimi genotipi. SKLOP IMUNOLOGIJA V naši raziskavi se bomo osredotočili na okužbe pri bolnikih s prirojenimi imunskimi pomanjkljivostmi, ki jih bomo fenotipsko in genetsko opredelili [agamaglobulinemija, splošna stanja imunske pomanjkljivosti (CVID)]. Pri bolnikih z imunsko pomanjkljivostjo bomo analizirali celične in molekularne mehanizme, ki so pomembni pri obrambi proti glivami. Raziskava bo prispevala k boljšemu razumevanju patogeneze glivičnih bolezni in k izboljšanju protiglivičnih zdravil in cepiv. Poleg tega bodo rezultati predlaganega programa pomembni pri naših nadaljnjih raziskavah pri bolnikih z glivičnimi boleznimi dihal. SKLOP VIROLOGIJA Opredelitev novih genotipov HPV lahko prispeva k boljšemu razumevanju virusne patogeneze in bolezni povezanih s HPV, oceni splošne raznolikosti in evolucijskih povezav HPV, izboljšanju virusne diagnostike in razvoju HPV-cepiv. Z molekularno analizo s HPV6/11 povzročenih malignih tumorjev bomo pomembno prispevali k boljšemu poznavanju karcinogeneze posredovane z nizkorizičnimi genotipi HPV. S preučevanjem epidemiologije enteričnih virusov bomo doprinesli k pojasnjevanju evolucijskih mehanizmov virusnega razvoja, kar je osnova za študijo patogeneze, razvoja cepiv in protimikrobnih učinkovin ter diagnostike. S korelacijo virusnih dejavnikov in gostiteljevega odziva bomo poskušali prepoznavati mehanizme patogeneze virusnih hemoragičnih mrzlic in s tem doprinesli k boljšemu razumevanju raznolikega poteka bolezni. SKLOP ZOONOZE Z izdelavo napovednih zemljevidov bomo opredelili poglavitne ekološke in antropološke dejavnike, ki vplivajo na porast incidence HMRS in tako pomagali k izboljšanju preventive. Razviti napovedni zemljevidi bodo uporabni tudi sosednjih državah, saj se zoonoze širijo glede na naravne ovire in ne nacionalne meje države. Razvili bomo sodobne diagnostične metode, ki bodo na voljo znanstvenikom v Sloveniji in drugod po svetu. Za razvoj znanosti je zelo pomembna vzpostavitev nacionalnih zbirk biobank vzorcev, ki omogočajo natančno genotipizacijo zoonotskih agensov, odkritje novih genotipov in povzročiteljev ter hitro izmenjavo informacij.
Pomen za razvoj Slovenije
SKLOP BAKTERIOLOGIJA Rezultati raziskav prevalence kolonizacije z enterobakterijami, ki izločajo ESBL, bodo temelj za oblikovanje učinkovitih priporočil za preprečevanja širjenja teh bakterij. S trenutnim znanjem in priporočili namreč ni mogoče dovolj učinkovito zajeziti širjenja teh večkratno odpornih bakterij v bolnišnicah. Enako velja za bakterije CA-MRSA, kjer bomo z boljšim poznavanjem omogočili ustrezne javnozdravstvene ukrepe. Z molekularnimi in antigenskimi metodami, bomo izboljšali diagnostiko bakterijskih in glivnih okužb in s tem pripomogli k optimizaciji zdravljenja. SKLOP IMUNOLOGIJA V zadnjih desetletjih incidenca glivnih okužb narašča, predvsem med imunsko oslabljenimi bolniki. Pri raziskavi bomo proučili interakcijo med različnimi vrstami Candida spp. in gostiteljevimi vnetnimi celicami ter skušali ugotoviti, kako imunski odziv vpliva na potek in izhod teh okužb. Rezultati raziskav bodo omogočili boljše poznavanje imunoloških procesov, s čimer bomo prispevali k boljši klinični obravnavi in zdravljenju teh okužb. SKLOP VIROLOGIJA V sklopu raziskave (mehanizmov) karcinogeneze posredovane z nizkorizičnimi genotipi HPV bomo prvič uporabili metodo globokega sekveniranja in številna programska orodja za analizo in primerjavo sekvenčnih podatkov, kar bo po naši oceni pomembno vplivalo na razvoj stroke in inženirske prakse v Sloveniji. Z racionalno diagnostiko virusnih okužb bomo lahko pravočasno zaznali epidemije v okolju in znotraj zdravstvenih in varstvenih ustanov kar ima vpliv na obolevnost, smrtnost, racionalno uporabo protimikrobnih zdravil in neposredne stroške povezane z obravnavo bolnika. Hkrati bomo z rezultati raziskav zagotavljali osveženo podatkovno zbirko virusnih genetskih linij, ki se pojavljajo v Sloveniji. Z vzpostavitvijo standardnih protokolov za dokaz virusnih povzročiteljev ob nepojasnjenih okužbah in na podlagi lastnih podatkovnih zbirk bomo lahko vodili in razvijali najuspešnejši mikrobiološki diagnostični center v Sloveniji. Z razumevanjem patogeneze virusnih hemoragičnih mrzlic bomo lahko ocenili možnost uporabe že registriranih zdravil pri zdravljenju težkih oblik bolezni. SKLOP ZOONOZE Z raziskavami bomo izboljšali nadzor nad pojavljanjem in pogostnostjo različnih zoonotskih patogenov v Sloveniji ter omogočili natančno opredelitev stopenj tveganja za okužbo. S tem bomo prispevali k bolj usmerjenem ozaveščanju javnosti in postavili temelje za razvoj preprečevalnih in zajezitvenih ukrepov. Rezultat bo izboljšano javno zdravje kot tudi večja ekonomičnost le-tega na področjih spremljanja in obvladovanja zoonoz. Ustvariti želimo nacionalno zbirko izolatov virusov, ki krožijo v Sloveniji, s čimer bomo prispevali k večjem vedenju o razširjenosti in pogostnosti teh agensov in njihovih različic v Sloveniji. V okviru evropskega projekta, pa bomo omogočili promocijo in distribucijo virusov in virusnih produktov drugim raziskovalnim ustanovam, ki izvajajo tako bazične kot aplikativne raziskave.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2015, vmesno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2015, vmesno poročilo
Zgodovina ogledov
Priljubljeno